More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2272 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  63.46 
 
 		 216 aa  284  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  45.37 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  37.25 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  39.8 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  38.86 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  39.52 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.41 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  38.97 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  35.27 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  36.59 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.59 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  36.41 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  38.78 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.71 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.71 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.71 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.71 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  35.75 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  34.95 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  38.27 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  39.27 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  35.27 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  35.44 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  35.27 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  42.07 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  40.21 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  37.69 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  37.69 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  37.69 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  34.5 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  37.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  37.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  37.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  37.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  37.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  37.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  37.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  37.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.01 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  38.66 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  38.66 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  36.54 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  36.54 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  33.66 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.14 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  40.82 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  38.92 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  39.49 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  39.18 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  39.02 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  39.09 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  37.19 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  37.19 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  37.19 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  37.19 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  38 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  36.41 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  36.41 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  36.41 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  36.41 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  33.83 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  35.44 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  35.53 
 
 		 218 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  34.85 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  38.69 
 
 		 202 aa  121  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  35.35 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  36.79 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.13 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  38 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  38 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  38 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  38 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  38 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  35.53 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  35.53 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  35.75 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  35.53 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  36.5 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  35.82 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  37.25 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  37.65 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  35.15 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  37.65 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  37.65 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  37.65 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  37.65 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  34.46 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  34.46 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  34.46 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>