More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2079 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  45.02 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  39.23 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  39.53 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  42.57 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  40.82 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  40.82 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  40.82 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  40.31 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  42.08 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  42.08 
 
 		 208 aa  142  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  43.41 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39.81 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  39.3 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  39.6 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  40.89 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  40.89 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  39.8 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  39.8 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  40.89 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  40.89 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  39.8 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  41.58 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  38.58 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  39.8 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  38.92 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  38.36 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  39.69 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.18 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  36.32 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.11 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39.5 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  37.62 
 
 		 209 aa  131  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  36.28 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  40.29 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  40.5 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  35.96 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1412  hypothetical protein  38.92 
 
 		 204 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1171  hypothetical protein  44.44 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.534638  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  37.37 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  37.37 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  35.64 
 
 		 202 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  35.19 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  36.59 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  32.98 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  32.98 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  34.33 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  39.38 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  35.44 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  37.8 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.95 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  34.8 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  37.62 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  35.03 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  37.25 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  30.56 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  38.46 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  37.76 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  37.76 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  37.76 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  36.89 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  37.76 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  37.76 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  31.31 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  37.76 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  34.74 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  40.78 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  40.78 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  40.78 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  33.5 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  40.78 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  32.35 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  32.35 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  40.78 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  40.78 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  33.67 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  38.31 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  40.78 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  40.78 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  33.5 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.18 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  35.82 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  35.92 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  40.78 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  34.33 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  35.82 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  33.83 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  37.24 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  37.24 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  37.24 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  33.96 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  33.65 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>