More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0972 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  98.55 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  96.14 
 
 		 207 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  96.14 
 
 		 207 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  95.65 
 
 		 207 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  85.85 
 
 		 206 aa  358  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  85.85 
 
 		 206 aa  358  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  85.37 
 
 		 206 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  85.37 
 
 		 206 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  85.37 
 
 		 206 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  85.37 
 
 		 206 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  85.37 
 
 		 206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  85.85 
 
 		 206 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  74.88 
 
 		 207 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  73.91 
 
 		 207 aa  321  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  74.15 
 
 		 206 aa  317  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  56.44 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  58.42 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  53.62 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  51.94 
 
 		 207 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  51.69 
 
 		 207 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  47.98 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  46.46 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  53.53 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  43.15 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  49.06 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  44.68 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  41 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  39.47 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  36.04 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  38.42 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  40.31 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  37.69 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  37.69 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  37.56 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  37.24 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0696  hypothetical protein  39.2 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.264493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  37.24 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0621  hypothetical protein  39.2 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.154187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  37.24 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  37.3 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  37.3 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  35.38 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  36.32 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  37.37 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  37.37 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  38.27 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  37.17 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  36.41 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  37.37 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  38.66 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37.44 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  38.58 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.84 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  39.55 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  39.55 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  36.73 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  38.98 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  39.55 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38.54 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  37.89 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  36.65 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  36.65 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  36.04 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  35.64 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  35.64 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  35.64 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  35.64 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  38.71 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  38.19 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  35.35 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  38.19 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  36.55 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  36.55 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  35.38 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  36.18 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  40.12 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  40.12 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  40.12 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  40.12 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  40.12 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  36.13 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  38.89 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  38.89 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  38.89 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  38.89 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  38.89 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  38.89 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  36.68 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  36.68 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>