More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1098 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  66.01 
 
 		 213 aa  256  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  50.5 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  47.8 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  47.8 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  47.8 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  47.8 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  47.8 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  47.8 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  47.32 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  45.45 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  46.46 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  47.32 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  47.74 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  47.32 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  48.24 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  47.34 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  47.12 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  45.37 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  53.53 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  53.53 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  53.53 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  53.53 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  52.94 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  52.94 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  43.9 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  42.08 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  39.67 
 
 		 205 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  46.63 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  36.13 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  39.18 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  35.75 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.33 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  35.92 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  37.04 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  36.14 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  33.5 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  36.55 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  35.68 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  34.55 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  39.6 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  36.17 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  34.03 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  33.82 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  35.75 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  34.02 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  34.02 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  34.55 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  34.03 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  33 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  34.03 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3632  hypothetical protein  40.41 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  36.93 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.64 
 
 		 205 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  33.68 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  35.68 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  33.51 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  32.34 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  32.34 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  36.32 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  37.97 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  36.32 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  35.68 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  33.51 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  35.68 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  33.51 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  36.32 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  36.32 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  35.68 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  33.33 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  34.85 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  34.55 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  35.56 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2200  hypothetical protein  33.49 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138246  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  32.65 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  32.98 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  36.5 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  40.36 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  30.99 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  32.98 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  32.98 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  32.98 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  34.55 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  31.5 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  35.23 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  38.1 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  34.74 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  31 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  32.09 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  32.09 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  37.31 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  35.23 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  35.23 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  34.33 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  34.72 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  30.1 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>