More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2619 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  99.51 
 
 
206 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  99.51 
 
 
206 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  99.03 
 
 
206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  96.12 
 
 
206 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  85.37 
 
 
207 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  85.37 
 
 
207 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  85.37 
 
 
207 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  85.37 
 
 
207 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  84.39 
 
 
207 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  84.39 
 
 
207 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  83.41 
 
 
207 aa  352  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  74.27 
 
 
207 aa  324  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  72.82 
 
 
206 aa  322  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  73.3 
 
 
207 aa  322  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  58.91 
 
 
213 aa  251  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  59.9 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  53.14 
 
 
207 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  52.43 
 
 
207 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  52.17 
 
 
207 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  45.85 
 
 
210 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  47.8 
 
 
213 aa  175  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  43.88 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  52.2 
 
 
213 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  42.93 
 
 
202 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  42.7 
 
 
204 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  38.19 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  37.37 
 
 
208 aa  121  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0696  hypothetical protein  38.19 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.264493  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0621  hypothetical protein  38.19 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.154187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  36.32 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  36.32 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  34.36 
 
 
211 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  38.42 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  38.22 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  41.28 
 
 
213 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  39.2 
 
 
203 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  41.28 
 
 
213 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  41.28 
 
 
213 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  41.28 
 
 
213 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  36.22 
 
 
203 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  36.22 
 
 
203 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  36.22 
 
 
203 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  37.63 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.32 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  39.08 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  39.08 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  36.92 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.84 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36.32 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  44.22 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  36.22 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  44.22 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  44.22 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  39.76 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  35.68 
 
 
205 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  34.74 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  40.12 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  40.12 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  40.12 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  40.12 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  43.54 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  40.12 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  33.68 
 
 
207 aa  111  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  36.82 
 
 
205 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  35.9 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  36.56 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  36.56 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3632  hypothetical protein  42.16 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  35.9 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  33.5 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  37.58 
 
 
209 aa  111  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  42.18 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  36.82 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  34.74 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  37.65 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  37.65 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  37.95 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  36.32 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  34.21 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  34.21 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  36.41 
 
 
206 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  37.06 
 
 
203 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  35.82 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  36.13 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  40.43 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  34.21 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  34.21 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  34.21 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  34.21 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>