More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2344 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  91.79 
 
 		 207 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  89.86 
 
 		 207 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  58.94 
 
 		 207 aa  257  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  59.42 
 
 		 207 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  56.44 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  57.43 
 
 		 215 aa  241  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  54.11 
 
 		 207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  54.11 
 
 		 207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  54.11 
 
 		 207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  53.62 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  53.62 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  53.62 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  54.59 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  52.66 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  53.62 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  53.62 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  53.14 
 
 		 206 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  53.14 
 
 		 206 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  53.14 
 
 		 206 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  53.14 
 
 		 206 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  53.14 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  53.62 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  46.63 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  50.5 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  49.48 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  43.81 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  39.7 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  37.06 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  38 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  41.12 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  33.5 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  33.5 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  36.98 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  38.17 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  37.31 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  34.34 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.1 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.56 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  38.07 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  40.31 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  37.19 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  34.65 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  35.68 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  34.95 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  34.38 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  35.2 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  36.04 
 
 		 204 aa  118  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  36.6 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  37.63 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2200  hypothetical protein  32.57 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138246  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  32 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  34.2 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  34.2 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  31.55 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  33.85 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  31.55 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  35.35 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  31.55 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  33.82 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  31.55 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  35.16 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  35.48 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  35.16 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  35.16 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  34.67 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  39.06 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  35.16 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  35.16 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  34.18 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  34.18 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  34.18 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  34.5 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  34.41 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  34.41 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  34.41 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  34.41 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  34.41 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3632  hypothetical protein  37.81 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  35.26 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0587  yadS protein  35.38 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  36.22 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  34.2 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  32.66 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  35.26 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  32.29 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  35.9 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  34.17 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  31.25 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  34.2 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  34.36 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  33.16 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  32.04 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  32.66 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  39.25 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  33.16 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  33.16 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>