More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0456 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
210 aa  417  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  47.21 
 
 
207 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  49.24 
 
 
206 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  46.67 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  47.72 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  46.15 
 
 
213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  46.63 
 
 
207 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  45.85 
 
 
206 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  45.85 
 
 
206 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  45.85 
 
 
206 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  45.85 
 
 
206 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  45.85 
 
 
206 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  45.85 
 
 
206 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  50 
 
 
213 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  46.39 
 
 
207 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  45.36 
 
 
207 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  45.37 
 
 
206 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  45.45 
 
 
206 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  45.1 
 
 
207 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  47.32 
 
 
213 aa  175  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  46.46 
 
 
207 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  46.46 
 
 
207 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  46.46 
 
 
207 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  46.46 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  45.88 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  45.88 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  39.09 
 
 
205 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  40.58 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  41.36 
 
 
204 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  34.63 
 
 
209 aa  125  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  40.49 
 
 
222 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  37 
 
 
200 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  35.64 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  36.95 
 
 
219 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  37.31 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  37.31 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  37.31 
 
 
213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  38.27 
 
 
213 aa  117  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  37.25 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  36.95 
 
 
217 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  36.51 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  36.82 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  36.73 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  36.54 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  36.18 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31288  predicted protein  34.16 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00253453  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  35.05 
 
 
211 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  35.32 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  35.32 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  35.32 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  35.32 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  39.71 
 
 
221 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  39.71 
 
 
221 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  35.05 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  36.68 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  35.29 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  35.29 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.92 
 
 
208 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  35.68 
 
 
211 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  35.57 
 
 
220 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.38 
 
 
201 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  39.9 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.92 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  36.92 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  38 
 
 
207 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  38.97 
 
 
207 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  37.56 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  37.5 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  39.42 
 
 
202 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  39.42 
 
 
202 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  39.42 
 
 
202 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  39.42 
 
 
202 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  34.13 
 
 
205 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  39.42 
 
 
202 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  36.14 
 
 
207 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3632  hypothetical protein  40.31 
 
 
204 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  38.94 
 
 
202 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  33.17 
 
 
223 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  34.16 
 
 
206 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.38 
 
 
208 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.34 
 
 
203 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  36.36 
 
 
204 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36.73 
 
 
208 aa  104  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.73 
 
 
211 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  36.52 
 
 
209 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  33.82 
 
 
205 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  35.42 
 
 
205 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  38.54 
 
 
207 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  38.14 
 
 
203 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  35.12 
 
 
202 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  38.83 
 
 
204 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  34.17 
 
 
211 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  34.54 
 
 
206 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>