More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0734 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  93.18 
 
 		 220 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  58.62 
 
 		 211 aa  254  6e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  52.97 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  42.41 
 
 		 203 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  40.41 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  41.88 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  41.88 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  39 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  39.3 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  42.55 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  42.02 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  38.86 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  40.31 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  38.86 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  38.86 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  38.86 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  38.86 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  38.86 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  38.92 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  39.38 
 
 		 202 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  35.15 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  35.15 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  37 
 
 		 208 aa  148  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  35.15 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  35.15 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  36.95 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  37.31 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.5 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  38.38 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  37.81 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  37.95 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.14 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.66 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.82 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.66 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  36.82 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.17 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  38.97 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  38.97 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36.5 
 
 		 208 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  38.97 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  37.44 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  40.1 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  33.66 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33.66 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  34.87 
 
 		 206 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  34.87 
 
 		 206 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  39.9 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.32 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  40.1 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  36.73 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  35.5 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  38.97 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37.56 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  37.56 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  35.47 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  37.37 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  36.87 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  36.68 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  38.31 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  38.31 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  37.88 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  36.76 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  36.73 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  38.02 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.76 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.31 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  36.79 
 
 		 205 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  35.2 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  35.53 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  35.82 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  34.83 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  35.18 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  39.39 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  34.43 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  36.18 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.27 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  35.9 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  36.5 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  35.9 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  32.2 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  35.38 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  36.92 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  33.83 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  37.17 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  35.05 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  34.98 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  33.82 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  34.18 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  36.08 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  33.67 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  35.47 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  37.37 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>