More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1246 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  81.86 
 
 		 217 aa  363  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  82.16 
 
 		 213 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  82.16 
 
 		 213 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  81.69 
 
 		 213 aa  359  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  81.69 
 
 		 213 aa  358  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  81.69 
 
 		 213 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  81.69 
 
 		 213 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  81.69 
 
 		 213 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  81.69 
 
 		 213 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1346  hypothetical protein  94.37 
 
 		 213 aa  345  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000407033  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  82.49 
 
 		 217 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  81.43 
 
 		 212 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  77.62 
 
 		 212 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  74.75 
 
 		 203 aa  265  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  55.88 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  55.88 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  53.52 
 
 		 223 aa  232  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  52.5 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  52.5 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  52.5 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  52.24 
 
 		 205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  54.41 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  54.41 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  54.41 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  54.41 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  54.41 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  46.6 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  53.92 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  53.92 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  53.92 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  53.92 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  53.92 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  53.92 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  53.92 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  53.92 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  53.92 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  50.25 
 
 		 213 aa  208  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  52 
 
 		 203 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  52.76 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  45.37 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  50.75 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  51.76 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  49.5 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  50.99 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  47.52 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  51.24 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  45.63 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  45.63 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  51.27 
 
 		 203 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  47.52 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  48.28 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  48.98 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  48.98 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  47.52 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  49.22 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  48.99 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  48.45 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  48.45 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  48.45 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  48.45 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  48.45 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  48.29 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  48.45 
 
 		 202 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  49.49 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  48.48 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  45 
 
 		 203 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  46.5 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  44.5 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  44.5 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  44.5 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  44.5 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0621  hypothetical protein  47.8 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.154187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0696  hypothetical protein  47.8 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.264493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  46.8 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  45.08 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  43.41 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  45.6 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  41.43 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5014  hypothetical protein  46.15 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  40.2 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  40.69 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  40.59 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  38.07 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  39.51 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38.38 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  38.38 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  40.91 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  38.38 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  38.05 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  38.05 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  38.05 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  38.05 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  37.88 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  42.21 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  37.38 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  39.91 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  37.38 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>