More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1346 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1346  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000407033  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  94.37 
 
 
215 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  81.52 
 
 
217 aa  362  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  80.75 
 
 
213 aa  357  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  80.75 
 
 
213 aa  357  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  80.75 
 
 
213 aa  357  8e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  81.69 
 
 
213 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  81.69 
 
 
213 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  81.69 
 
 
213 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  81.69 
 
 
213 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  80.28 
 
 
213 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  83.18 
 
 
217 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  83.33 
 
 
212 aa  328  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  80 
 
 
212 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  74.75 
 
 
203 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  53.92 
 
 
206 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  53.92 
 
 
206 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  52.63 
 
 
223 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  55.39 
 
 
205 aa  215  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  55.39 
 
 
205 aa  215  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  55.39 
 
 
205 aa  215  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  55.39 
 
 
205 aa  215  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  55.39 
 
 
205 aa  215  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  55.39 
 
 
205 aa  215  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  55.39 
 
 
205 aa  215  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  55.39 
 
 
205 aa  215  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  55.39 
 
 
205 aa  215  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  52 
 
 
203 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  52 
 
 
203 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  52 
 
 
203 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  54.9 
 
 
205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  54.9 
 
 
205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  54.9 
 
 
205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  54.9 
 
 
205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  54.9 
 
 
205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  51.24 
 
 
205 aa  210  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  52.74 
 
 
205 aa  210  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  51.27 
 
 
213 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  45.85 
 
 
222 aa  205  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  51.5 
 
 
203 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  49.5 
 
 
205 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  45.73 
 
 
222 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  47.03 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  50.75 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  51.49 
 
 
205 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  50.25 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  51.72 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  47.78 
 
 
207 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  47.03 
 
 
207 aa  191  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  48.48 
 
 
206 aa  191  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  50.25 
 
 
203 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  47.03 
 
 
207 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  48.79 
 
 
210 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  45.32 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  45.32 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  48.99 
 
 
208 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  47.98 
 
 
208 aa  184  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  47.76 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  45 
 
 
203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  46.63 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  45.88 
 
 
202 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  45.88 
 
 
202 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  45.88 
 
 
202 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  45.88 
 
 
202 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  45.88 
 
 
202 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  45.88 
 
 
202 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0696  hypothetical protein  48.78 
 
 
210 aa  174  7e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.264493  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0621  hypothetical protein  48.78 
 
 
210 aa  174  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.154187  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  43.5 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  43.5 
 
 
203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  43.5 
 
 
203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  43 
 
 
203 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  45.08 
 
 
203 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  45.1 
 
 
204 aa  168  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  44.04 
 
 
203 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  42.93 
 
 
209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5014  hypothetical protein  44.51 
 
 
214 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  42.42 
 
 
208 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  37.93 
 
 
203 aa  158  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  41.54 
 
 
206 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  39.39 
 
 
208 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  39.39 
 
 
208 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  38.89 
 
 
208 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  40.4 
 
 
208 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  39.22 
 
 
209 aa  154  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  38.89 
 
 
208 aa  154  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  39.9 
 
 
208 aa  154  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  40.91 
 
 
211 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  39.27 
 
 
208 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  39.27 
 
 
208 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  39.27 
 
 
208 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  39.27 
 
 
208 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  38.38 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  39.39 
 
 
207 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  37.38 
 
 
207 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  38.69 
 
 
208 aa  147  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  41.71 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  36.55 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>