More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0698 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
203 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  49.23 
 
 
200 aa  207  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  50.52 
 
 
209 aa  192  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  45.27 
 
 
209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  41.03 
 
 
203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  41.5 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  40.72 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  44.21 
 
 
208 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  46.6 
 
 
206 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  44.21 
 
 
208 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  43.68 
 
 
208 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  41.97 
 
 
208 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  41.15 
 
 
213 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  41.15 
 
 
213 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  41.15 
 
 
213 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  41.15 
 
 
213 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  40.62 
 
 
217 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  43.16 
 
 
208 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  44.21 
 
 
208 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  43.16 
 
 
208 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  44.74 
 
 
207 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  43.68 
 
 
211 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  45.83 
 
 
208 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  42.63 
 
 
207 aa  154  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  42.11 
 
 
208 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  39.06 
 
 
213 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  42.11 
 
 
208 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  42.11 
 
 
208 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  42.11 
 
 
208 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  39.58 
 
 
213 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  39.06 
 
 
213 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  39.06 
 
 
213 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  37.13 
 
 
206 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  43.75 
 
 
208 aa  148  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  38.14 
 
 
206 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  38.66 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.39 
 
 
201 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  38.27 
 
 
207 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  42.78 
 
 
219 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  35.79 
 
 
207 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.92 
 
 
206 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  33.17 
 
 
222 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  35.79 
 
 
207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  38.07 
 
 
206 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0587  yadS protein  41.67 
 
 
210 aa  136  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  34.74 
 
 
213 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  36.84 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  36.92 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  36.45 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  36.56 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  37.1 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  37.1 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  34.18 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  36.22 
 
 
202 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  35.48 
 
 
206 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  35.2 
 
 
223 aa  132  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  35.48 
 
 
206 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  36.95 
 
 
209 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  37.13 
 
 
215 aa  131  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  36.95 
 
 
204 aa  131  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  131  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  35.5 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  36.56 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  41.4 
 
 
204 aa  130  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  35.75 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  38.19 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  35.94 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  36.02 
 
 
203 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  35.44 
 
 
210 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  37.95 
 
 
220 aa  129  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  37.95 
 
 
220 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  36.95 
 
 
212 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  38.31 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  33.87 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  33.87 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  33.87 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  37.5 
 
 
217 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  31.68 
 
 
221 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  36.16 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  38.31 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  31.68 
 
 
221 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  36.98 
 
 
205 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  32.67 
 
 
222 aa  127  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  36.98 
 
 
205 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  38.34 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  36.98 
 
 
205 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  36.98 
 
 
205 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  36.98 
 
 
205 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  36.98 
 
 
205 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  34.72 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  36.98 
 
 
205 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>