More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1380 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  56.59 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  54.5 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  57.07 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  57.58 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  54.15 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  55.67 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  55.67 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  55.67 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  54.19 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  55.17 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  54.19 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  54.19 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  54.19 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  54.37 
 
 		 208 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  53 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  52.53 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  49.75 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  50.74 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  50.97 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  49.5 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  48.48 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  48.48 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  51.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  47.98 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  47.98 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  51.01 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  45.89 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  46.97 
 
 		 213 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  46.97 
 
 		 213 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  46.97 
 
 		 213 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  46.97 
 
 		 213 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  47.76 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  56.85 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  52.53 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  52.53 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  52.53 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  52.53 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  52.53 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  52.53 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  52.53 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  52.53 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  52.53 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  54.27 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  47.52 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  43 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  43 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  51.01 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  51.01 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  51.01 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  51.01 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  51.01 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  52.02 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  52.02 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  52.02 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  46.57 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  43.32 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  43.32 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  50.75 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  43.35 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  48.97 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  41.71 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  41.71 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  41.71 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  48.98 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  41.71 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  46.8 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  46.35 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  41 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  43.65 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  44.67 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  43 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  44.28 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  49.75 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  41.71 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  47.64 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  41.71 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  42.78 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  42.57 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  42.25 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  38.78 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  43.09 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  43.09 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  43.85 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  43.35 
 
 		 217 aa  147  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  39.38 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  45.1 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  41.62 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  44.1 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  44.1 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  40.82 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  39.2 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1171  hypothetical protein  51.5 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.534638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  44.39 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  43.94 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  42.78 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  47.8 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  47.8 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  43.37 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  43.37 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>