More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6354 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  40.8 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  43.35 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  39.11 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  40.72 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  44.83 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  41.12 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  38.81 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  39.3 
 
 		 208 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38.81 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  38.81 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  38.31 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  39.3 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  36.73 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.81 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  37.81 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  37.81 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  37.81 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  37.81 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  37.75 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  36.45 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  36.95 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  37.24 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  37.24 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  40.59 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  35.96 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  38.54 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  37.24 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  37.24 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  37.24 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  35.47 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  41.46 
 
 		 206 aa  131  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  37.24 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  38.19 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  37.24 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  37.24 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  39.8 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  38.05 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  38.05 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  37.24 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  45.24 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  38.92 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.01 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  35.18 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  33.85 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  34.67 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  39.59 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  39.58 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  39.3 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  33 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  37.68 
 
 		 205 aa  124  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  34.17 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  38.27 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  36.27 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  36.82 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  35.2 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  36.46 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  39.9 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  35.64 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  36.82 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  37.81 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  35.75 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  34.38 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  38.78 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  34.38 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  39.9 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  35.2 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  34.9 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  35.94 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  35.94 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  34.38 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  34.67 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  32.51 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  34.67 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  34.67 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  36.76 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  35.29 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  35.94 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  37.76 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  36.55 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  36.55 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  38.19 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  34.72 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  35.57 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  33.66 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  35.18 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  30.05 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  32 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  35.57 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  35.57 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  37.82 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  36.55 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  32.37 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  32.37 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  32.37 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  32.37 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  37.24 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>