More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3728 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  70.19 
 
 
209 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  43.56 
 
 
205 aa  171  9e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  46.63 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  44.16 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  45.15 
 
 
231 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  43.37 
 
 
211 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  45.96 
 
 
201 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  43.56 
 
 
212 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  43.56 
 
 
212 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  43.56 
 
 
212 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  44.61 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  46.19 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  38.94 
 
 
213 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  37.91 
 
 
217 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  38.94 
 
 
213 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  38.94 
 
 
213 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  38.94 
 
 
213 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  47.69 
 
 
222 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  39.3 
 
 
213 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  46.11 
 
 
212 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  37.98 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  37.98 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  37.98 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  45.5 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  41.24 
 
 
211 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  43.14 
 
 
212 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  42.27 
 
 
201 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  43.5 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  43.5 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  43.15 
 
 
205 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  39.59 
 
 
204 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  47.24 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  39.68 
 
 
211 aa  132  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  33 
 
 
203 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  43 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  37 
 
 
202 aa  131  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.96 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  41.84 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  34 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  41.21 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  38.97 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  43.46 
 
 
212 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  39.32 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  39.69 
 
 
218 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39.3 
 
 
205 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  48.06 
 
 
210 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  38.42 
 
 
217 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  38.61 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  38.16 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  36.92 
 
 
230 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  42.57 
 
 
216 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  38 
 
 
205 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  42 
 
 
206 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  43.08 
 
 
206 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.13 
 
 
208 aa  121  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  33.98 
 
 
263 aa  121  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  38.42 
 
 
209 aa  121  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  40.8 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  34.33 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  31.61 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  42.21 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  37.24 
 
 
223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38.83 
 
 
208 aa  118  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  37.32 
 
 
208 aa  118  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_002950  PG0587  yadS protein  39.29 
 
 
210 aa  118  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  37.75 
 
 
207 aa  118  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  37.44 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  37.93 
 
 
208 aa  117  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  37.19 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  34.16 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  36.76 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  36.27 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.95 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  35.12 
 
 
206 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  36.68 
 
 
208 aa  115  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  38.1 
 
 
203 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  39.47 
 
 
221 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  35.18 
 
 
222 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  43.37 
 
 
204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.32 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  35.15 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  36.63 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  37.75 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  37.17 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  38.38 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  37.17 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  37.76 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  38.46 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  33.66 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  36.14 
 
 
205 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  38.34 
 
 
205 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  41.71 
 
 
203 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.41 
 
 
208 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  39.51 
 
 
220 aa  112  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>