More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0682 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  88.21 
 
 		 213 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  60.4 
 
 		 206 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  60.4 
 
 		 206 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  59.9 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  59.9 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  59.9 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  59.9 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  59.9 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  58.91 
 
 		 207 aa  247  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  58.42 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  58.42 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  58.42 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  57.92 
 
 		 207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  58.91 
 
 		 206 aa  244  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  57.43 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  57.43 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  57.43 
 
 		 207 aa  241  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  58.42 
 
 		 207 aa  241  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  57.92 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  56.44 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  56.93 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  55.94 
 
 		 207 aa  235  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  46.67 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  48.98 
 
 		 213 aa  177  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  46.46 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  41.71 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  41.12 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  38.12 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  34 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  38.58 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  34 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  34.69 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  38.58 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  35.2 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.16 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  34.18 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  38.66 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.69 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.69 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  37.19 
 
 		 202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  35.5 
 
 		 206 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  39.78 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  37.19 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  37.19 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  37.19 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  36.68 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  36.68 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  36.68 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  36.68 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  36.68 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  35.86 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  36.04 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  34.47 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  36.04 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  37.69 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  36.18 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  36.18 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  34.85 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  35.68 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  34.67 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  31.16 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  31.16 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.55 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.5 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  34.67 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  34.85 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  34.67 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  34.17 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  33.17 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  37.88 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  32.84 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  35.35 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  33.5 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  34.5 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  40.83 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  34.5 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  34.5 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  31.82 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  36.5 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  34.17 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.18 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.35 
 
 		 205 aa  117  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  34.17 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  37.69 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.35 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  35.29 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  31.82 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  36.14 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  34.17 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  34.34 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>