More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2916 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  81.31 
 
 
206 aa  300  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  77.89 
 
 
205 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  66.83 
 
 
201 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  76.12 
 
 
206 aa  276  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  57.58 
 
 
205 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  56.57 
 
 
205 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  46.23 
 
 
206 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  48.47 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  47.96 
 
 
206 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  46.7 
 
 
206 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  44.95 
 
 
207 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  45.92 
 
 
203 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  41.41 
 
 
209 aa  156  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  41.71 
 
 
202 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  45.41 
 
 
209 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  40.49 
 
 
209 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  42.29 
 
 
211 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  44.85 
 
 
211 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  42.64 
 
 
208 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  43.94 
 
 
207 aa  148  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  41.71 
 
 
209 aa  147  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  46.15 
 
 
204 aa  147  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  42.64 
 
 
208 aa  147  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  38.19 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  43.22 
 
 
208 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  39.18 
 
 
200 aa  144  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  38.92 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  38.38 
 
 
211 aa  144  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  38.31 
 
 
203 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  42.13 
 
 
206 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  42.64 
 
 
208 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  43.43 
 
 
214 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  41.62 
 
 
208 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  44.95 
 
 
215 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  42.64 
 
 
208 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  42.13 
 
 
208 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  41.84 
 
 
208 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  41.92 
 
 
208 aa  141  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  42.64 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  43.15 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  43.15 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  43.22 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  43.15 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  43.15 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  42.86 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  42.86 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  42.47 
 
 
219 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  39.18 
 
 
211 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  42.64 
 
 
207 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  42.64 
 
 
212 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  48.67 
 
 
212 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  41.12 
 
 
212 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  41.12 
 
 
212 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  41.12 
 
 
212 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  42.86 
 
 
208 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  35.44 
 
 
211 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  40.4 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  41.62 
 
 
246 aa  134  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  39.09 
 
 
208 aa  134  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  37.37 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  37.75 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  40.58 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  38.69 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  40.61 
 
 
222 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  39.68 
 
 
211 aa  132  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  37.93 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  37.93 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  39.9 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  41.71 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  41.84 
 
 
208 aa  131  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  36.36 
 
 
211 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  41.09 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  34.95 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  35.92 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  36.55 
 
 
204 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  38.38 
 
 
209 aa  129  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  43.15 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  43.15 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  43.15 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  43.15 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  43.15 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  42.13 
 
 
219 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  42.64 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  42.64 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  42.64 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  42.64 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  42.64 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  42.64 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  42.64 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  40.2 
 
 
204 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  42.64 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  39.59 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  37.31 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  42.13 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  39.11 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  38.73 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  38.19 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  37.31 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>