More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2523 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  70.19 
 
 		 208 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  43.2 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  43.22 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  46.5 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  45.92 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  47.76 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  47.45 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  45.27 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  42.42 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  39.71 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  42.21 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  42.21 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  42.21 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  43.2 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  44.09 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  41.38 
 
 		 251 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  42.25 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  39.22 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  39.22 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  39.22 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  39.22 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  41.71 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  38.39 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  44.56 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  38.73 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  38.73 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  44.56 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  38.73 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  44.56 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.79 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  40.82 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  36.79 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  46.8 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  40.49 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  41.21 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  42.94 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  45.23 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  36.95 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  37.5 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  43.46 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  38.19 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  38.42 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  34.13 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  34.83 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  42.18 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  41.18 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  37.56 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  39.71 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  40.7 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  34.72 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  43.43 
 
 		 216 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  34.15 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  34.69 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  38.5 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  43.08 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  34.93 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  38.58 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  34.03 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  37.56 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  39.39 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  35.35 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  32.06 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  32.06 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  35.89 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  33.66 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  36.41 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  36.79 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  34.7 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  38.81 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  38.79 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  41.29 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  34.27 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  40.85 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  41.36 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  37 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  42.33 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  35.8 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  40.74 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  40.74 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  30.35 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  30.35 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  37.68 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  33.98 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  34.15 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  32.84 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  34.18 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  41.03 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  31.79 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  34.74 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  40.34 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  31.34 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  33.17 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  40.59 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  34.83 
 
 		 216 aa  111  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  33.5 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38.25 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  41.18 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  31.63 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>