More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0180 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  391  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  53.57 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  50.25 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  48.54 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  49.51 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  47.55 
 
 		 213 aa  174  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  45.73 
 
 		 204 aa  160  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  45.18 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  44.78 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  38.89 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  38.38 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  41.55 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  40.58 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  42.35 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.39 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  41.84 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  39.32 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  37.89 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  35.5 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  40.89 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  38.27 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  39.3 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  38.31 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  36.6 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  45.64 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  41.51 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  41.51 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.33 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.69 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  41.51 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  39.69 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  36.27 
 
 		 231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  38.07 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  38.58 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  34.52 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  34.67 
 
 		 213 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  39 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  36.18 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  34.52 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  32.32 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  33.67 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  33.67 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  36 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  33.85 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  36.55 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  35.98 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  42.11 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  35.8 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  37.06 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  34.72 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  39.27 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  34.72 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  34.72 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  34.72 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  35.85 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  34.31 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  33.01 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  34.98 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  35.5 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  37.7 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  34.2 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  34.2 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  34.2 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  35.15 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  38.22 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  38.22 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  34.2 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  33.67 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  33.67 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  34.54 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  35.35 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  36.1 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  35.18 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  36.22 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38.22 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  35.71 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  32.11 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  34.12 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  36.32 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  34.2 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  34.2 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  32.14 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  32.14 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  33.82 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  39.69 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  34.87 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  36.36 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>