More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0350 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  54.77 
 
 
208 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  54.73 
 
 
208 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  52.74 
 
 
206 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  52.74 
 
 
208 aa  208  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  51.69 
 
 
208 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  50.24 
 
 
211 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  51.74 
 
 
208 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  51.74 
 
 
208 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  51.74 
 
 
208 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  51.74 
 
 
208 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  51.24 
 
 
208 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  51.24 
 
 
208 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  50.75 
 
 
208 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  51.74 
 
 
208 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  53.03 
 
 
207 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  51.24 
 
 
208 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  51.74 
 
 
207 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  51.76 
 
 
207 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  53.03 
 
 
206 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  51.52 
 
 
206 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  49.49 
 
 
203 aa  181  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  47.98 
 
 
206 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  44.7 
 
 
219 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  49.49 
 
 
204 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  49.49 
 
 
204 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  49.49 
 
 
204 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  51.24 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  50.75 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  50.75 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  50.25 
 
 
207 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  42.29 
 
 
206 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  47.52 
 
 
204 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  37.84 
 
 
223 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  41.46 
 
 
209 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  41.46 
 
 
209 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  42.55 
 
 
206 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  43.59 
 
 
218 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  36.63 
 
 
217 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  37.13 
 
 
213 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  36.54 
 
 
213 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  36.54 
 
 
213 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  36.54 
 
 
213 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  38.39 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  36.54 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  36.54 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  36.54 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  43.5 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  36.54 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  40.61 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  40.61 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  39 
 
 
208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  42.02 
 
 
208 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  38.86 
 
 
203 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  41.49 
 
 
208 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  41.03 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  40.11 
 
 
222 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  41.62 
 
 
201 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  42.29 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  41.26 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  37.06 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  40.1 
 
 
209 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  40.64 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  38.14 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  39.49 
 
 
208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  40.64 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  40.96 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  37.56 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1412  hypothetical protein  39.29 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  40.72 
 
 
204 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  34.34 
 
 
203 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  41.62 
 
 
206 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.77 
 
 
206 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  44.5 
 
 
211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  40.51 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  36.41 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1171  hypothetical protein  43.63 
 
 
208 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.534638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  40.1 
 
 
205 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  42.59 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  42.59 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  42.59 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  42.59 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  42.59 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  42.59 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  42.59 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  42.59 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  42.59 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  35.53 
 
 
200 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  40.31 
 
 
217 aa  125  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>