More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1412 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1412  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  40.2 
 
 
203 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37.44 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  39.15 
 
 
209 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  39.15 
 
 
209 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  45.16 
 
 
204 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  36.95 
 
 
206 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  39.09 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  41.12 
 
 
204 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  38.86 
 
 
217 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  39.09 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  39.09 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  40.38 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  39.09 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  39.29 
 
 
246 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.09 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  38.54 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  38.34 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  38.58 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  37.62 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1850  hypothetical protein  35.61 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  38.58 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  38.58 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  42.5 
 
 
206 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  35.47 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  38.19 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  34.95 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.61 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  35.78 
 
 
208 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1555  protein of unknown function UPF0126  34.63 
 
 
209 aa  124  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.283277  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  39.87 
 
 
208 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  39.87 
 
 
208 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  39.87 
 
 
208 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  39.87 
 
 
208 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  36.54 
 
 
208 aa  124  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  42.68 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  34.47 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  41.98 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  32.51 
 
 
238 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  41.57 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  33.5 
 
 
211 aa  118  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  40.2 
 
 
207 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  35.08 
 
 
203 aa  118  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  33.85 
 
 
218 aa  117  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  31.32 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  42.95 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  36.81 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  36.81 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  35.68 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  33.85 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.98 
 
 
206 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  36.36 
 
 
207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  35.35 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  38.46 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  38.14 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  33.51 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  33.82 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  36.14 
 
 
202 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  36.05 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  36.05 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  32.83 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  33.92 
 
 
205 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  33.92 
 
 
205 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  33.92 
 
 
205 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  33.92 
 
 
205 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  33.92 
 
 
205 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  33.92 
 
 
205 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  33.92 
 
 
205 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  33.92 
 
 
205 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  33.92 
 
 
205 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  36.47 
 
 
209 aa  111  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  32.82 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  32.65 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  30.39 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  30.6 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  35.9 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  37.56 
 
 
206 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  34.5 
 
 
223 aa  109  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  30.1 
 
 
206 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  35.09 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  32.34 
 
 
221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  32.34 
 
 
221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  42.04 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  36.81 
 
 
208 aa  108  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>