More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1850 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1850  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1555  protein of unknown function UPF0126  87.08 
 
 		 209 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.283277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.9 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1412  hypothetical protein  35.61 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  40.24 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  39.38 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  37.13 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  35.86 
 
 		 246 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  36.87 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  39.13 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  35.07 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  38.76 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  35.93 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  35.93 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  34.76 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  34.64 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  38.38 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  35.87 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  36.1 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  37.19 
 
 		 218 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  35.24 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  36.79 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  35.12 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  38.15 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  32.51 
 
 		 238 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  34.17 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  35.61 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  34.83 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  35.61 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  35.61 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  40.14 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  35.35 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  32.14 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  33.97 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  32.62 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  30.85 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  35.27 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  33.01 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  36.22 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  33.16 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  35.27 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  34.11 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  41.72 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  36.24 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  35.27 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  35.27 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  38 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.8 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  32.68 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  33.02 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  34.63 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  33.65 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  32.37 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  34.15 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  34.69 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  32.37 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  35.1 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  34.63 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  36.42 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  34.65 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  38.69 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  35.03 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  34.65 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  32.16 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  31.22 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  36.07 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  34.65 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  33.49 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  33.49 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  38.75 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  34.65 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  37.33 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  30.29 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  30.29 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  30.29 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  30.29 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  30.62 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  39 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  39 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  38.51 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  39 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  39 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  38.51 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  39 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  34.62 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  37.44 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  29.81 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  32.14 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  33.01 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>