More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1929 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  53.57 
 
 
204 aa  191  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  52.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  50.99 
 
 
209 aa  187  8e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  50.7 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  51.96 
 
 
208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  41.06 
 
 
205 aa  153  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  40.31 
 
 
205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39.27 
 
 
205 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  41.88 
 
 
201 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  37.06 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  40.96 
 
 
222 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  33.99 
 
 
211 aa  134  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  41.71 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  38.34 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  38.14 
 
 
222 aa  131  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  37.11 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  35.53 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  36.68 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  41.48 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.9 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  40.57 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  41.88 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  39.49 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  35.5 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  34.83 
 
 
199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  40.21 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  34.83 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  35.45 
 
 
200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  40.21 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  38.54 
 
 
202 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  37.17 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  35.12 
 
 
205 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  38.46 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  34.85 
 
 
209 aa  125  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  38.02 
 
 
202 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  36.13 
 
 
203 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  36.13 
 
 
203 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  36.13 
 
 
203 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  38.02 
 
 
202 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  35.11 
 
 
213 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  38.02 
 
 
202 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  35.11 
 
 
213 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  38.02 
 
 
202 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  38.02 
 
 
202 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  35.6 
 
 
203 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  35.11 
 
 
213 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  38.02 
 
 
202 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  35.11 
 
 
213 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.69 
 
 
209 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  34.69 
 
 
210 aa  123  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  36.7 
 
 
217 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  36.14 
 
 
221 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  36.55 
 
 
215 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  40.93 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  40.93 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  40.91 
 
 
206 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  36.55 
 
 
213 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  39.61 
 
 
207 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
206 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  33.17 
 
 
203 aa  121  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  34.76 
 
 
203 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  40.4 
 
 
211 aa  121  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  36.6 
 
 
206 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  35.29 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  37.43 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  37.95 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  39.38 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  36.92 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  34.57 
 
 
213 aa  117  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.57 
 
 
213 aa  117  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  32.16 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  33.83 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  34.9 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.04 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.04 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  36.04 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  36.84 
 
 
210 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  35.45 
 
 
212 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  37.31 
 
 
205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  36.73 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  31.75 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.13 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  32.63 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  37.17 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  36.27 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  37.68 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36.65 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  36.65 
 
 
251 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  36.5 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  37.04 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  37.7 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  33.67 
 
 
203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  33.67 
 
 
203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  33.67 
 
 
203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  35.38 
 
 
217 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>