More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5955 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  44.85 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  47.5 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  44.39 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  45.45 
 
 		 230 aa  150  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  45.92 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  45 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  43.5 
 
 		 303 aa  141  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  49.38 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  44.62 
 
 		 231 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  44.85 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  42.13 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  41.54 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  37.84 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  44.85 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  40.8 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  40.8 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  40.8 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  43.78 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  38.92 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.37 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  38.38 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  39.9 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.14 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  34.74 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  37.7 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  33.51 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  43.37 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  40.3 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1387  protein of unknown function UPF0126  44.16 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  39.39 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  43.81 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  31.79 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  42.11 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  40.31 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  38.81 
 
 		 246 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.63 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  39.8 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1077  protein of unknown function UPF0126  37.8 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  37.56 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  37.88 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  37.09 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.17 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  38.92 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  31.98 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  36.22 
 
 		 206 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  42.27 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  37.76 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  40.82 
 
 		 251 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.68 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  34.2 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  36.79 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  37.31 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  36.46 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  32.49 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  37.31 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  38.38 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  34.2 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  33.67 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  42.48 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  37.31 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.55 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  33.16 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  38.54 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  36.18 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  33.67 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  36.65 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  39.49 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3514  hypothetical protein  41.54 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.996987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  35.2 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  40.71 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  36.6 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  38.06 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.41 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.27 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  30.1 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  34.65 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  40.85 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.27 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.27 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.27 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  31.86 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  33.16 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  39.75 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  36.5 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  38.97 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  38.97 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  34.67 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  34.67 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>