More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0830 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 251 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  53.43 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  52.17 
 
 		 215 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  51.76 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  51.76 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  51.76 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  51.03 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  51.92 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  43.93 
 
 		 222 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  41.38 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  41.45 
 
 		 211 aa  149  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  49.28 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  45.64 
 
 		 211 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  46.91 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  44.61 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  41.87 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  46.91 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  44.28 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  45.88 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  41.09 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  41.24 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  36.5 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  42.5 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  42.5 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.82 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.32 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  43.37 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  42.5 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  43.65 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  47.13 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  37.56 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.65 
 
 		 209 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  33.17 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  48.67 
 
 		 216 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  40.82 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  38.81 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  39.8 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  36.82 
 
 		 209 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  39.2 
 
 		 215 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  38.6 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1387  protein of unknown function UPF0126  43.56 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  36.63 
 
 		 206 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  44.27 
 
 		 203 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  44.52 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  42.64 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  34.34 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  41.46 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  34.83 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  37.82 
 
 		 203 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  37.82 
 
 		 203 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  37.82 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  38.07 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  34.3 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  34.74 
 
 		 200 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 204 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1034  hypothetical protein  41.75 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.859571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  35.03 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  35.44 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.82 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  40.39 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  34.8 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.99 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.99 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  33.99 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  35 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  32.04 
 
 		 223 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  37.11 
 
 		 203 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  32.02 
 
 		 206 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  41.46 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  43.67 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  29.38 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  36.1 
 
 		 208 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  39.26 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  39.26 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  35.58 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  36.84 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 213 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  38.19 
 
 		 205 aa  95.9  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  34.16 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  33.93 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  37.91 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  38.61 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  38.37 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  35.9 
 
 		 203 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  41.14 
 
 		 206 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  39.71 
 
 		 226 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4542  hypothetical protein  41.38 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0210008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  36.14 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  40.13 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  35.71 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  34.67 
 
 		 213 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>