More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1493 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  417  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  81.07 
 
 
208 aa  339  2e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  74.31 
 
 
220 aa  320  7e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  69.9 
 
 
209 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  50.7 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  47.55 
 
 
204 aa  174  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  41.55 
 
 
205 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  42.51 
 
 
205 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  40.29 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  36.45 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.96 
 
 
206 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  38.94 
 
 
206 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  41.31 
 
 
209 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  38.94 
 
 
206 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  39.52 
 
 
204 aa  121  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  37.44 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  35.82 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  35.82 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  39.51 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  36.41 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  41.21 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  118  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  118  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.7 
 
 
209 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  37.93 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  37.32 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  34.7 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  33.49 
 
 
206 aa  113  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3937  hypothetical protein  34.83 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000127693  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  38.46 
 
 
208 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  38.19 
 
 
203 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  37.69 
 
 
203 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  37.69 
 
 
203 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  35.89 
 
 
199 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  35.41 
 
 
199 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  37 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  32.51 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  37 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  37 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  36.36 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.6 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.6 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  36 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  36 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  36 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  36.36 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.6 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  36 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  33.98 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  36 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.6 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  36.82 
 
 
202 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  37.85 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  31.28 
 
 
210 aa  108  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 
211 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  36.68 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  37.93 
 
 
217 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  38.02 
 
 
203 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  37.38 
 
 
203 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  32.5 
 
 
203 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  39.41 
 
 
214 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  37.32 
 
 
203 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  35.56 
 
 
206 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  34.13 
 
 
211 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  33.5 
 
 
200 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  36.41 
 
 
222 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.33 
 
 
209 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  34.11 
 
 
217 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  36.87 
 
 
211 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  41.95 
 
 
209 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  37.19 
 
 
203 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  35.68 
 
 
213 aa  104  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  38.54 
 
 
203 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  35.41 
 
 
218 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.67 
 
 
213 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.67 
 
 
213 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  36.68 
 
 
203 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  37.5 
 
 
203 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  33 
 
 
202 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.67 
 
 
213 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  35.52 
 
 
205 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.31 
 
 
208 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  33.48 
 
 
222 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  40.79 
 
 
212 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  40.79 
 
 
212 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  40.79 
 
 
212 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  36.45 
 
 
206 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  33.49 
 
 
218 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  33.18 
 
 
205 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  33.5 
 
 
213 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  33.49 
 
 
218 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  33.49 
 
 
211 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>