More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0580 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  388  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  97.49 
 
 
199 aa  381  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  97.49 
 
 
223 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  85.43 
 
 
208 aa  343  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  70.77 
 
 
206 aa  275  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  55.84 
 
 
204 aa  204  6e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  44.33 
 
 
218 aa  153  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  42.78 
 
 
216 aa  151  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  40.21 
 
 
223 aa  145  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2312  protein of unknown function UPF0126  45.88 
 
 
217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.27452 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0980  protein of unknown function UPF0126  42.13 
 
 
202 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0539  protein of unknown function UPF0126  44.16 
 
 
219 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  41.84 
 
 
204 aa  132  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  39 
 
 
210 aa  131  6e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  38.66 
 
 
203 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  34.83 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  37.26 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  35.86 
 
 
202 aa  122  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  37.07 
 
 
220 aa  119  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  38.42 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  32.82 
 
 
205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  37.62 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  32.34 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  32.99 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.22 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  35.41 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  36.68 
 
 
206 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  31.55 
 
 
209 aa  108  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  31.79 
 
 
201 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  31.79 
 
 
210 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  33.85 
 
 
211 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  32.82 
 
 
207 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  33 
 
 
211 aa  104  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  32.82 
 
 
208 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  33.83 
 
 
207 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  32.52 
 
 
207 aa  101  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  34.36 
 
 
208 aa  101  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  35.5 
 
 
209 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  34 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  35.53 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  32.66 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  33.67 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  31.66 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  33.16 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  31.44 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  36.22 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  35.71 
 
 
207 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  35.71 
 
 
207 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  35.71 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  36.22 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  35.71 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  32.5 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  35.2 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  35.2 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  35.2 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  30.05 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  35.2 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1386  hypothetical protein  32.09 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  91.7  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  32.47 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  32.12 
 
 
208 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  32.12 
 
 
208 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  29.95 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0633  protein of unknown function UPF0126  27.18 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  30.43 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  35.29 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2180  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  90.5  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  29.61 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  33.98 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  29.5 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  29.5 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1380  thioredoxin reductase (trxr)  31.09 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0825177  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  31.61 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  31.66 
 
 
200 aa  89  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  32.34 
 
 
204 aa  89  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  30.88 
 
 
205 aa  88.2  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  35.35 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  35.35 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  28.72 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  35.35 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  35.35 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  35.35 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  35.35 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  34.85 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  35.35 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  35.71 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  35.35 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>