More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1580 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  391  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  48.47 
 
 		 202 aa  197  7.999999999999999e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  43.88 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  37.62 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1386  hypothetical protein  39.25 
 
 		 202 aa  148  7e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1380  thioredoxin reductase (trxr)  37.88 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0825177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  42.29 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  38.42 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  38.16 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  38.89 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  38.19 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  38.66 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  39.49 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  39 
 
 		 204 aa  117  7.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  32.49 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  35.12 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  31.96 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  33.68 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  30.3 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  30.3 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  37.07 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  30.5 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  35.61 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  30.15 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  32.31 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  32.31 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  32.31 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  32.31 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  32.31 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  32.31 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  33.5 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  30.37 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  32.04 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  37.06 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  31.28 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  33 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  35.9 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  31.55 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  31.98 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  32.66 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  32.02 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  31.96 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  32.46 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  29.15 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  36.32 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  30.96 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  31.28 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  32.65 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  30 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  30 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  30 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  32.34 
 
 		 208 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  31.68 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  32.34 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  30.21 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  30.96 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  30 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  32.32 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  32.32 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  33 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  30.61 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  31.09 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  31.47 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  30.2 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  31.47 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  31.47 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  30.2 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  32.09 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  30.96 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  34.38 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  31.98 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  33.17 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  31.47 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  32.98 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  30 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  29.5 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  28.64 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  31.12 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  33 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  30.2 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  33 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  31.03 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  31.03 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  31.03 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  31.03 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  30.5 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  31.44 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  31.28 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  29.47 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  31.44 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  34.85 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  28.14 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  31 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  31.44 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  33.51 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  31.44 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  30 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  38.31 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  29.02 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  30.1 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>