More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0753 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  46.31 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  36.45 
 
 
205 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.81 
 
 
205 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  38.1 
 
 
204 aa  135  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  38.83 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  38.35 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  39.8 
 
 
199 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  39 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  37.2 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  38.31 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  35.92 
 
 
203 aa  127  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  35.5 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.78 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.68 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  35.78 
 
 
208 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  34.47 
 
 
207 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  38.46 
 
 
206 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  34.11 
 
 
206 aa  124  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.89 
 
 
208 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.78 
 
 
208 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  34.3 
 
 
201 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  38.31 
 
 
204 aa  123  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  35.78 
 
 
208 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  36.1 
 
 
207 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  36.06 
 
 
209 aa  122  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  32.84 
 
 
206 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  37.62 
 
 
205 aa  121  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  35.61 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  34.47 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  34.47 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  34.47 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  34.47 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  35.07 
 
 
206 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  33.82 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  34.76 
 
 
208 aa  116  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  35.38 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2180  hypothetical protein  38.79 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  34.47 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0980  protein of unknown function UPF0126  33 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.33 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  31.84 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.98 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  34.85 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  34.8 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2312  protein of unknown function UPF0126  31.86 
 
 
217 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.27452 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  31.25 
 
 
218 aa  109  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  35.12 
 
 
203 aa  109  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  32.35 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  31.28 
 
 
213 aa  108  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  31.66 
 
 
207 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  32.58 
 
 
220 aa  108  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  34.65 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0539  protein of unknown function UPF0126  33.73 
 
 
219 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  30.62 
 
 
209 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  32 
 
 
223 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  32.52 
 
 
205 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  33.17 
 
 
214 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  34.65 
 
 
207 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  31.66 
 
 
207 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  30.96 
 
 
207 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  31.78 
 
 
211 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  30.96 
 
 
207 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  30.96 
 
 
207 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  30.96 
 
 
207 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  34.34 
 
 
251 aa  104  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  30.29 
 
 
206 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  37.31 
 
 
208 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  32.18 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  32.18 
 
 
202 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  35.12 
 
 
204 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  33.73 
 
 
200 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  30.46 
 
 
207 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  35.12 
 
 
204 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  35.12 
 
 
204 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  31.73 
 
 
206 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  34.63 
 
 
210 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  34.83 
 
 
210 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  34.83 
 
 
210 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  31.03 
 
 
206 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  31.03 
 
 
206 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  33.83 
 
 
210 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  34.33 
 
 
210 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  34.33 
 
 
210 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>