More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0874 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
202 aa  390  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  48.77 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  48.47 
 
 
203 aa  197  7.999999999999999e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  47.26 
 
 
210 aa  181  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1386  hypothetical protein  44.39 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1380  thioredoxin reductase (trxr)  41.09 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0825177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  35.5 
 
 
206 aa  128  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  39.3 
 
 
204 aa  123  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  35.86 
 
 
199 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  35.86 
 
 
199 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  35.5 
 
 
223 aa  121  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  35.68 
 
 
208 aa  121  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.08 
 
 
201 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  35.94 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  38.19 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  35.5 
 
 
218 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  33.83 
 
 
222 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  36.41 
 
 
206 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  33.67 
 
 
205 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  33.16 
 
 
205 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  34.17 
 
 
215 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  36.08 
 
 
223 aa  105  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0633  protein of unknown function UPF0126  33 
 
 
226 aa  104  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  35.32 
 
 
213 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  36.87 
 
 
223 aa  104  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  34.98 
 
 
209 aa  104  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0980  protein of unknown function UPF0126  36.13 
 
 
202 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0539  protein of unknown function UPF0126  36.73 
 
 
219 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  32.18 
 
 
210 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.98 
 
 
209 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.1 
 
 
206 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  34.01 
 
 
208 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5014  hypothetical protein  36.93 
 
 
214 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  32.32 
 
 
206 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  34.93 
 
 
220 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  40.85 
 
 
207 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  32.99 
 
 
208 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2312  protein of unknown function UPF0126  35 
 
 
217 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.27452 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  38.14 
 
 
208 aa  100  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  32.98 
 
 
213 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  34.9 
 
 
210 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  32.98 
 
 
213 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  32.98 
 
 
213 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  32.98 
 
 
213 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  40.12 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  40.12 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  34.69 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.33 
 
 
209 aa  99  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  32.98 
 
 
217 aa  98.6  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  36.14 
 
 
202 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  34.55 
 
 
219 aa  98.2  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.54 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.03 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  39.51 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  31.28 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  39.51 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  39.51 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  39.51 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  37.28 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  30.3 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  35.32 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.51 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.51 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  32.98 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  32.64 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  34.18 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  33.85 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  30.26 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  32.47 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  34.33 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  30.26 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  36.18 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  35.4 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  33.83 
 
 
208 aa  94  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  30.26 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  33.15 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  33.67 
 
 
209 aa  94  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  36.55 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  31.28 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  32.64 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  30.05 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  33.83 
 
 
207 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  31.96 
 
 
206 aa  91.7  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  92  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>