More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1380 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1380  thioredoxin reductase (trxr)  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0825177  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1386  hypothetical protein  80 
 
 		 202 aa  317  6e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  63.05 
 
 		 207 aa  260  8e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  58.82 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  41.09 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  37.88 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  36.76 
 
 		 222 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  34.47 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  33 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  37.25 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  33.17 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  37.25 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  35.75 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  35.75 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  35.75 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  35.75 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  35.75 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  35.75 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  35.75 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  36.22 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  33.5 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  33.51 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  34.72 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  31.58 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  32.98 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  32.98 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  34 
 
 		 209 aa  98.2  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  35.2 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  30.96 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  32.46 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  32.51 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  32.63 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  32.51 
 
 		 220 aa  95.1  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  32.02 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  30.81 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  31.73 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  30.21 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  30.21 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  30.77 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  32.65 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  32.99 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  33.16 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  32.99 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  31.79 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  31.5 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  32.14 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  34.36 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5014  hypothetical protein  32.95 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44242 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  31.86 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  31.22 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  31.09 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  32.98 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  31.55 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  31.47 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  31.47 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  29.65 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  30.15 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  29.15 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0980  protein of unknown function UPF0126  31.41 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  30.77 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  29.15 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  29.15 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  31.28 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  29.15 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  30.46 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  30.46 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  30.89 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  32.18 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  30.89 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  30.89 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  30.89 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  30.05 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  32.56 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  31.41 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  29.74 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  26.7 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  30.46 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  31.5 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  30.65 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  29.53 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  29.95 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0539  protein of unknown function UPF0126  30.37 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  31.98 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  31.41 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  32.14 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  28.78 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  30.77 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  33 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0621  hypothetical protein  32.47 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.154187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0696  hypothetical protein  32.47 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.264493  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  29.56 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  32.84 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  29.7 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  26.37 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  29.65 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  29.65 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  29.65 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>