More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0926 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  60.1 
 
 
210 aa  266  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1380  thioredoxin reductase (trxr)  63.05 
 
 
202 aa  260  8.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0825177  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1386  hypothetical protein  61.78 
 
 
202 aa  250  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  48.77 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  37.62 
 
 
203 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  37.06 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  34.67 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  32.52 
 
 
204 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  34.65 
 
 
210 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 
206 aa  104  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  32 
 
 
222 aa  104  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  33.83 
 
 
221 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  33.83 
 
 
221 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  31.6 
 
 
223 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  32.52 
 
 
199 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  30.2 
 
 
199 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  34.03 
 
 
202 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  34.17 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  33.51 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  32.97 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  33.51 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  33.51 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  33.51 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  33.51 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  29.41 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  33.93 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  31.03 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  31.03 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  32.52 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  34 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  32.83 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  31.07 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  30.05 
 
 
203 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  30.05 
 
 
203 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  30.05 
 
 
203 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  34 
 
 
208 aa  94.7  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  31.41 
 
 
203 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5014  hypothetical protein  31.72 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  29.56 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  30.89 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  30.89 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  31.66 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  27.64 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  27.64 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.86 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  31.94 
 
 
203 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  31.66 
 
 
205 aa  92  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  29 
 
 
203 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  28.86 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  30.26 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  35.12 
 
 
223 aa  90.5  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  30 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  30.89 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  30.29 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  32.5 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  30.37 
 
 
203 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  28.57 
 
 
218 aa  88.2  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  30.37 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  28.79 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  30.35 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  29.35 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  29.5 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  32.7 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  29.85 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  33.51 
 
 
208 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  26.53 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  31.47 
 
 
213 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  31.47 
 
 
213 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  31.47 
 
 
213 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  31.47 
 
 
213 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  31.61 
 
 
208 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  30.46 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  30.96 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  30.46 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  30.96 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  30.46 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  31.47 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  30.46 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  29.44 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  29.8 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  29.56 
 
 
216 aa  85.1  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  33.66 
 
 
216 aa  85.1  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0539  protein of unknown function UPF0126  28.92 
 
 
219 aa  84.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  28.57 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  30.85 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  30.46 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  30.81 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  30.96 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  33.51 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  29.95 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  31.12 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  30.96 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  30.96 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  29.52 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  30.35 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  29 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  28.57 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  29.95 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>