More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0434 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
204 aa  390  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  58.71 
 
 
206 aa  230  8.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  54.5 
 
 
208 aa  209  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  55.94 
 
 
223 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  55.9 
 
 
199 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  55.84 
 
 
199 aa  204  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  45.73 
 
 
204 aa  160  9e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  39.39 
 
 
216 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  36.63 
 
 
218 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  36.87 
 
 
223 aa  141  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  42.29 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  38.1 
 
 
210 aa  135  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0539  protein of unknown function UPF0126  36.68 
 
 
219 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0980  protein of unknown function UPF0126  35.9 
 
 
202 aa  134  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2312  protein of unknown function UPF0126  36.63 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.27452 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  38.34 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  38.86 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  40.59 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  34.8 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  40.59 
 
 
203 aa  121  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  36.67 
 
 
208 aa  121  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  34.63 
 
 
209 aa  121  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.31 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  34.5 
 
 
205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  34.69 
 
 
205 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  35.5 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  37.32 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  36.04 
 
 
211 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1380  thioredoxin reductase (trxr)  34.47 
 
 
202 aa  112  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0825177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  35.71 
 
 
222 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  35.07 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  35.07 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  35.07 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  32.34 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  35.07 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  35.61 
 
 
204 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  34.6 
 
 
207 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  34.6 
 
 
207 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  34.6 
 
 
207 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  34.6 
 
 
207 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  34.6 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  34.6 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  30.65 
 
 
213 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  35.71 
 
 
214 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.38 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  36.82 
 
 
206 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  32.52 
 
 
207 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  37.06 
 
 
207 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  35.78 
 
 
207 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  33.67 
 
 
206 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  32.83 
 
 
201 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  31.16 
 
 
215 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  32.5 
 
 
209 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 
221 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  34.01 
 
 
221 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  32 
 
 
200 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  35.23 
 
 
208 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  34.87 
 
 
208 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  34.87 
 
 
208 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  38.5 
 
 
202 aa  104  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  32.16 
 
 
205 aa  104  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  34.52 
 
 
210 aa  103  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  34.6 
 
 
210 aa  103  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  35.38 
 
 
212 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  35.38 
 
 
212 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  33.17 
 
 
206 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  35.38 
 
 
212 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  32.86 
 
 
209 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  34.36 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0633  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
226 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  32.52 
 
 
205 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  34.72 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  34.72 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  34.36 
 
 
208 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  34.36 
 
 
208 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  34.36 
 
 
208 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  34.36 
 
 
208 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  33.5 
 
 
211 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  30.05 
 
 
205 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  35.64 
 
 
219 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
251 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.83 
 
 
209 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  32.32 
 
 
207 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  101  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  31.16 
 
 
213 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  31.16 
 
 
213 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  33.83 
 
 
208 aa  101  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  31.16 
 
 
213 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  34.33 
 
 
205 aa  101  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  31.16 
 
 
213 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1386  hypothetical protein  35.64 
 
 
202 aa  100  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  35.2 
 
 
203 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>