More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1386 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1386  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  402  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1380  thioredoxin reductase (trxr)  78.71 
 
 
202 aa  332  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0825177  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  61.58 
 
 
207 aa  262  3e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  61.39 
 
 
210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  43.22 
 
 
202 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  38.97 
 
 
203 aa  151  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  32.83 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  31.66 
 
 
222 aa  104  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  35.53 
 
 
204 aa  104  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  34.52 
 
 
221 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  34.52 
 
 
221 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  33.83 
 
 
202 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  33.83 
 
 
202 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  33.83 
 
 
202 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  32.84 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  35.42 
 
 
203 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  34.9 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  33.83 
 
 
202 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  34.9 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  33.83 
 
 
202 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  31.12 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  33.16 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  31.66 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  30.51 
 
 
209 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  32.67 
 
 
223 aa  98.2  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  33.68 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  33.51 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  32.85 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  33.33 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  34.21 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  33.16 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  33 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  32.67 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  33.73 
 
 
219 aa  94.7  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  31.66 
 
 
203 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  32.12 
 
 
199 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  31.66 
 
 
203 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  31.66 
 
 
203 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  32.55 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  32.64 
 
 
199 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  31.63 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  34.18 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  33.16 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  30.81 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  30.81 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  30.81 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  31.16 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  30.81 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  31.41 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  30.81 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  30.81 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  31.31 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  31.46 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  32.83 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  30.69 
 
 
203 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  30.88 
 
 
210 aa  89  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  29.9 
 
 
207 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3047  hypothetical protein  30.3 
 
 
206 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0138976  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  32.81 
 
 
213 aa  88.2  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  29.44 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  29.44 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  31.5 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  31.5 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  29.65 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  32.82 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  32.84 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  31.5 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  31.5 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  30.1 
 
 
205 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  32.65 
 
 
207 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0980  protein of unknown function UPF0126  29.38 
 
 
202 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  30.35 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  28.64 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  31.28 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  32.32 
 
 
207 aa  85.5  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  32.81 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  30.1 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  29.44 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  31.5 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  31.09 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  30.73 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  28.64 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  32.46 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0633  protein of unknown function UPF0126  31 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  30.37 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0539  protein of unknown function UPF0126  30.26 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  26.73 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>