More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0716 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  60.1 
 
 
207 aa  266  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1380  thioredoxin reductase (trxr)  58.82 
 
 
202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0825177  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1386  hypothetical protein  60.94 
 
 
202 aa  242  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  47.26 
 
 
202 aa  181  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  43.88 
 
 
203 aa  169  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  36.19 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  32.85 
 
 
222 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  34.12 
 
 
204 aa  109  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  31.37 
 
 
204 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  30.43 
 
 
222 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  34.52 
 
 
204 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  32.32 
 
 
206 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  33.82 
 
 
213 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  34.42 
 
 
211 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  31.79 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  31.79 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  31.79 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  31.79 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  31.79 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  31.22 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  31.22 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  32.31 
 
 
202 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  32.08 
 
 
223 aa  98.2  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  31.79 
 
 
202 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  31.66 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  31.71 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  31.66 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  31.66 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  31.66 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  32.37 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  29.33 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  29.56 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  32.18 
 
 
199 aa  95.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  94.7  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  30.23 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  29.21 
 
 
207 aa  94  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  34.13 
 
 
211 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  32.81 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  32.04 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  32.5 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  33.01 
 
 
209 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  26.92 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  29.65 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  26.83 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  30 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  29.19 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  30.15 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  30.15 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  32.99 
 
 
208 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  32.29 
 
 
207 aa  91.7  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  29.65 
 
 
213 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  28.16 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  28.16 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  28.16 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  32.21 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  31.19 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  28.16 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  29.05 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5014  hypothetical protein  30.39 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44242 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  30.1 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  26.54 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  32.49 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  26.54 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  36.9 
 
 
205 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  31.75 
 
 
208 aa  89  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  32.49 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  30.21 
 
 
211 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  32.04 
 
 
207 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  32.04 
 
 
207 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0539  protein of unknown function UPF0126  29.19 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  32.95 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  26.73 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  32.04 
 
 
207 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  28.5 
 
 
203 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  32.04 
 
 
207 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  31.28 
 
 
203 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  27.72 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  29.95 
 
 
203 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  28.37 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  26.67 
 
 
205 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  31.55 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0633  protein of unknown function UPF0126  30.15 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  31.55 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  31.55 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  31.55 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  31.88 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  27.49 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  31.55 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  32.69 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  31.55 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>