More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0879 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 204 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  46.67 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  41.24 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  47.92 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  39.9 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  39.9 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  48.21 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  43.5 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  45 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  49.74 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  42.71 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  44.39 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  46.6 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  46.74 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  52.9 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  45.31 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  48.21 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  48.21 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  42.21 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  48.72 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  44.27 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  44.56 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  42.93 
 
 		 208 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  42.13 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  43.59 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  43.23 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  43.65 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  43.15 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  38.86 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  42.71 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  44.85 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  44.39 
 
 		 211 aa  138  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  48.69 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  42.71 
 
 		 208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  42.19 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  39.6 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  43.23 
 
 		 207 aa  137  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  42.71 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  43.65 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  42.86 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  42.71 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  42.71 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  39 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  39 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  39 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  39 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  40.62 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  38.19 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  38.8 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  38.8 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  38.8 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  45.08 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  45.08 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  45.08 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  42.19 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  42.19 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  42.19 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  42.19 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  37.7 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  37.7 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  40.41 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  40.4 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  39.04 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  38.73 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  44.56 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  44.56 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  44.56 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  44.56 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  44.56 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  44.56 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  44.56 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  44.56 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  44.33 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  44.33 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  44.33 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  44.33 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  44.33 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  44.33 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  39.04 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  38.58 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  39.04 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  39.04 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  38.5 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  40.41 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  40.62 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  37.62 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  40.82 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  38.24 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  40.41 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  39.04 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  44.04 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  35.79 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  36.41 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  37.5 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  39 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  36.32 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  36.32 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  36.32 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  36.32 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>