More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3287 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 221 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1387  protein of unknown function UPF0126  58.82 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  44.29 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  45.41 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  45 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  42.35 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  38.24 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  39.39 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  42.79 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  40.65 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  40.88 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  37.11 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  37.56 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  35.18 
 
 		 201 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.14 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  40.4 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  39.3 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  37.23 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  36.46 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  40.72 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  34.52 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  45.73 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  39.13 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  45.73 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  45.73 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  38.05 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  42.29 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  34.78 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  37.93 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  39.69 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  39.18 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  36.82 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  41.67 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  31.96 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  37.93 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  34.17 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  31.84 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  37.72 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  36.36 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  40.41 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  38.54 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  39.06 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  39.06 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  35.53 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  35.53 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  33.68 
 
 		 200 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  35.11 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  35.89 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  36.27 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  39.69 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  31.58 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  36.55 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  40.52 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  39.47 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  38.03 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  32.72 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  34 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  33.83 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  35.53 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  36 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  31.82 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  31.82 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  35.35 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  37.19 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  35.57 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  36.67 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  36.32 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  37.44 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  36.04 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  39.49 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33.67 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  36.67 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.32 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  35 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  35.11 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  35.11 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  37.76 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  30.61 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.04 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.04 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.04 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.04 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  32.99 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  35.11 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  32.65 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  34.04 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3937  hypothetical protein  33.17 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000127693  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  33.66 
 
 		 210 aa  99  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  34 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  34 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  28.93 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  32.82 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  34 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  33.16 
 
 		 208 aa  98.2  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  36.89 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  36.84 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  36.84 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  36.84 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  32.46 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  33.5 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>