More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1683 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  430  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  74.31 
 
 		 213 aa  320  8e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  67.79 
 
 		 208 aa  291  7e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  64.42 
 
 		 209 aa  272  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  52.61 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  48.54 
 
 		 204 aa  185  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  41.67 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  40.58 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  41.2 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  40.76 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  40.76 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  38.86 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  37.14 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  37.14 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  37.14 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  37.14 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  40.76 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  37.14 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  37.14 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  36.67 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  37.14 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  37.14 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  36.19 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  37.09 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  35.78 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3937  hypothetical protein  36.67 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000127693  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  34.11 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  38.12 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  37.07 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  39.32 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  37.56 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  37.91 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  37.74 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  33.82 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  32.84 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  40.83 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  34.48 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  35.51 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  35.51 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  35.51 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  38.19 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  35.71 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  31.68 
 
 		 203 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  35.47 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  34.51 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  41.06 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  36.67 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  32.26 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  32.26 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  32.26 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  35.89 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  32.26 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  35.89 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  35.89 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  35.89 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  35.89 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  35.89 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.1 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  35.16 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.64 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.64 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  37.69 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  34.76 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  36.1 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.18 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  37.69 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  34.29 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  37.44 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  32.58 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  37.69 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  37.19 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33.64 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  35.24 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  36.89 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  35.98 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  36.27 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  37.32 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  35.07 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  39.66 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  35.92 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  34.07 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  42.77 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  38.42 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  40.12 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  40.12 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  40.12 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  36.95 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  36 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.92 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.92 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.92 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.92 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  37.2 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  34.59 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  32.23 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>