More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0998 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  39.71 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  37.93 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.54 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  40.5 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  40.58 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  39.53 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  36.92 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  37.38 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2180  hypothetical protein  34.88 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  42.31 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  36.92 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  36.19 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  33.66 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.92 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  36.92 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  34.8 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  37.26 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  38.86 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  37.38 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  37.38 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  37.38 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  37.38 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  34.15 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.45 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.21 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  33.01 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  34.95 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  36.45 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  35.65 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.45 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  38.28 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  35.05 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  37.25 
 
 		 211 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  35.75 
 
 		 205 aa  125  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  39.17 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  37.74 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  38.1 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  36.62 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  35.38 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  38.35 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  34.76 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  37.09 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  37.09 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  36.71 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  34.88 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  37.56 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  37.8 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  40.21 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  36.63 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.18 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.18 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  37.32 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  38.57 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  32.72 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37.5 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  36.54 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  32.72 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  36.71 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  37.2 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  37.2 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  38.6 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  31.8 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  36.67 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  35.12 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  35.35 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  31.39 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  36.97 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1077  protein of unknown function UPF0126  37.8 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  40.59 
 
 		 204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  36.89 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  32.72 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  32.72 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  32.72 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  32.72 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  36.49 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  36.49 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  33.99 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  34.91 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  32.02 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  42.79 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  42.79 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  37.62 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  35.41 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  36.11 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  34.45 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>