More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1303 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  87.08 
 
 		 209 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  66.18 
 
 		 213 aa  248  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  50.49 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  50.5 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  52.88 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  54.77 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  48.51 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  48.06 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  48.06 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  48.06 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  49.5 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  49.74 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  48.06 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0525  hypothetical protein  46.31 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  44.44 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  43.43 
 
 		 205 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  42.93 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  42.36 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  39.25 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  39.25 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  39.25 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  39.25 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  39.51 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  40.1 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  43.65 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  42.23 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  40.1 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  39.6 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  39.6 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  37.85 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  39.6 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  42.71 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  41.21 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  39.7 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  41.31 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  37.13 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  35.47 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  39.59 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  38.65 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  36.5 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  46.78 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0500  hypothetical protein  43.81 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  38 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  39.2 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  41.67 
 
 		 246 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  40.19 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  46.2 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  38 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  35.96 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  38 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  39.8 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  39.8 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  39.8 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  39.8 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  41.33 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  39.8 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  41.06 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1550  hypothetical protein  42.86 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  38 
 
 		 208 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  37.13 
 
 		 211 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39.09 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  39.8 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  39.49 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  37.5 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  38.5 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2223  hypothetical protein  40.58 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.41 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  35.47 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  36.04 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  37.75 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.5 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.5 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.5 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.5 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  36.22 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  34.8 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  36.22 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  34.98 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  41.06 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  44.56 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  37.81 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  35.47 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  35.47 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  40.4 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  38.27 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  38.46 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  38.07 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  40.1 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  41.97 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  38.58 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  37.44 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  39.58 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  39.58 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  39.58 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>