More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0375 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  409  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.14 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  34.69 
 
 
209 aa  123  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.38 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  37.81 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.65 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  37.44 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  39.32 
 
 
220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  38.73 
 
 
222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  34.54 
 
 
205 aa  118  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  38 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  39.09 
 
 
208 aa  117  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  34.95 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  38.5 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38.5 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  37.37 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  36.63 
 
 
209 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  35.71 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  35.38 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  34.34 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  38.5 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  38.5 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  38.5 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  38.5 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  38.66 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  38.89 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  34.16 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.15 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  32.65 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  34.22 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  39.59 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  36 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.93 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  38.78 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  36.92 
 
 
206 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  36.6 
 
 
245 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.66 
 
 
209 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  36.36 
 
 
214 aa  111  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  34.98 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  36.76 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.2 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  32.65 
 
 
223 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  36.41 
 
 
207 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
206 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  34.34 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  32.35 
 
 
204 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  31.89 
 
 
222 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  34.5 
 
 
211 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  34.63 
 
 
219 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  29.95 
 
 
206 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  39.07 
 
 
213 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  31.79 
 
 
199 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  29.95 
 
 
206 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  36.14 
 
 
211 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  35.71 
 
 
202 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  32.35 
 
 
231 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  34.67 
 
 
208 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  41.75 
 
 
215 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  37.07 
 
 
211 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  34.2 
 
 
203 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  32.83 
 
 
206 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  31.79 
 
 
199 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  34.6 
 
 
204 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  30.69 
 
 
217 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  35.15 
 
 
206 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  29.35 
 
 
207 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  33.82 
 
 
221 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  37.82 
 
 
222 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  33.82 
 
 
221 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  35.86 
 
 
201 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  29.65 
 
 
207 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  32.67 
 
 
211 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  35.68 
 
 
203 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  30.15 
 
 
207 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  37.06 
 
 
206 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  37.31 
 
 
206 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  34.52 
 
 
204 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  35.47 
 
 
211 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  34.54 
 
 
212 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  34.54 
 
 
212 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  34.54 
 
 
212 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  29.21 
 
 
213 aa  101  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  35.53 
 
 
206 aa  101  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 
209 aa  101  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  38.69 
 
 
216 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  32.2 
 
 
204 aa  101  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  31.4 
 
 
230 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  32.14 
 
 
208 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  34.11 
 
 
211 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  30.2 
 
 
213 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  32.18 
 
 
211 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  32.11 
 
 
203 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  32.11 
 
 
203 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  31 
 
 
217 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  35.57 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  32.11 
 
 
203 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  35.57 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0696  hypothetical protein  39.09 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.264493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>