More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1231 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  80.98 
 
 
205 aa  333  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  63.37 
 
 
207 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  61.65 
 
 
207 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  61.65 
 
 
207 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  61.84 
 
 
207 aa  268  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  61.17 
 
 
207 aa  267  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  61.17 
 
 
207 aa  267  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  61.17 
 
 
207 aa  267  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  61.17 
 
 
207 aa  267  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  60.68 
 
 
207 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  60.68 
 
 
207 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  60.68 
 
 
207 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0633  protein of unknown function UPF0126  55.9 
 
 
226 aa  215  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  55.28 
 
 
204 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  36.41 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  32.84 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.08 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  33.8 
 
 
223 aa  111  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  36.55 
 
 
206 aa  111  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  37.21 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  36.82 
 
 
204 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  36.41 
 
 
202 aa  106  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  33.51 
 
 
205 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  35.94 
 
 
203 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  38.42 
 
 
220 aa  105  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  36.6 
 
 
206 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  36.23 
 
 
209 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  41.03 
 
 
206 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  35.53 
 
 
211 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  37.2 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  35.58 
 
 
210 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  32.29 
 
 
205 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  36.73 
 
 
206 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  35.42 
 
 
209 aa  101  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  35.53 
 
 
223 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  34.72 
 
 
214 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  35.78 
 
 
208 aa  100  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  34.01 
 
 
208 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  34.17 
 
 
206 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  34.17 
 
 
206 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.27 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  38.83 
 
 
213 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  35.47 
 
 
209 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  35.23 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  36.23 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1555  protein of unknown function UPF0126  37.58 
 
 
209 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.283277  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.23 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  32.41 
 
 
219 aa  98.2  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  34.58 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  39.44 
 
 
216 aa  97.8  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  40.38 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  35.53 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.61 
 
 
208 aa  97.1  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.54 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1850  hypothetical protein  36.24 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  35.89 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  35.53 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  35.53 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  35.03 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  35.53 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  35.53 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  35.53 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  32.82 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  35.03 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  41.03 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  33.49 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  94.7  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  32.84 
 
 
213 aa  94.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  34.3 
 
 
208 aa  94.4  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  29.13 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  35.53 
 
 
202 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  37.07 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  35.22 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  34.31 
 
 
207 aa  94  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  37.33 
 
 
207 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  35.23 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  31.09 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  34.45 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  30.35 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  39.89 
 
 
204 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  34.34 
 
 
200 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  34.5 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  37.67 
 
 
202 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  32.18 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  32.18 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  32.46 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  36.08 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  32.18 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  32.18 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  32.18 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  32.18 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  29.84 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  37.82 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>