More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3364 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
216 aa  421  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  42.79 
 
 
203 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  42.92 
 
 
210 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  43.4 
 
 
210 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  42.92 
 
 
210 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  42.92 
 
 
210 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  42.92 
 
 
210 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  42.92 
 
 
210 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  42.92 
 
 
210 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  42.92 
 
 
210 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  42.45 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  42.45 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3937  hypothetical protein  43.75 
 
 
210 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000127693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.38 
 
 
201 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  37.81 
 
 
211 aa  134  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39.18 
 
 
205 aa  134  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  38.86 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.83 
 
 
209 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  38.92 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  41.15 
 
 
208 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  41.15 
 
 
208 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  34.54 
 
 
204 aa  125  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  35.24 
 
 
218 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  37.88 
 
 
212 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  37.88 
 
 
212 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  37.88 
 
 
212 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  40.39 
 
 
207 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  41.84 
 
 
206 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  40.62 
 
 
208 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  40.62 
 
 
208 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  37.06 
 
 
211 aa  122  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  40.62 
 
 
208 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  38.27 
 
 
212 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  40.62 
 
 
208 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  42.49 
 
 
208 aa  122  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  40.8 
 
 
206 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.08 
 
 
206 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  38.69 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  38.86 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  40.1 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  39.11 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  40.99 
 
 
219 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  39.11 
 
 
206 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  42.07 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  39.11 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  37.82 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  36.62 
 
 
246 aa  117  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  36.68 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  33.02 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  33.02 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  40.41 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0633  protein of unknown function UPF0126  32.87 
 
 
226 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  35.38 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  37.5 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  32.56 
 
 
207 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  37.24 
 
 
200 aa  115  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  35.55 
 
 
215 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  34.78 
 
 
206 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  35.42 
 
 
209 aa  115  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  37.86 
 
 
208 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  32.09 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  32.09 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  35.02 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  34.01 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  36.63 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  35.44 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  34.26 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  36.14 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  36.63 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  36.14 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  36.14 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  36.63 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  36.14 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  36.55 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  34.5 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  30.85 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  33.49 
 
 
222 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  35.82 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  37.04 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  30.2 
 
 
221 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  33.66 
 
 
206 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2180  hypothetical protein  34.74 
 
 
219 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  34.05 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  32.99 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  37.37 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  33.5 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  33.99 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>