More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3402 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 217 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  61.14 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  57.01 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  61.93 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  57.89 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  52.15 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  43.63 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  47.98 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  54.87 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  46.19 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  52.13 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  50.77 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  50.75 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  50.75 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  42.29 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  50.25 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  44.55 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  44.55 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  44.55 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  48.97 
 
 		 200 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  45.36 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  48.74 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  47.45 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  40.8 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  41.36 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1034  hypothetical protein  49.48 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.859571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  43.37 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  38.31 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  45.19 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  40.59 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  37.13 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  43.37 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  39 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  36.63 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  36.63 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  36.63 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  36.63 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  36.63 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  36.63 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  36.63 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  44.1 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  35.64 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  37.88 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  37.88 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  42.71 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  43.15 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  42.31 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  42.16 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  35.32 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  35.32 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  40.49 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  40.8 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  41.67 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  41.35 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  33.01 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  39.13 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  36.81 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  36.81 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  35.6 
 
 		 203 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  35.92 
 
 		 211 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39.02 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  40.61 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  39.71 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  46.35 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  41.67 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  34.67 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  33.84 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  39.56 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  37.25 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  42.41 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  38.69 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  35.61 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  33.51 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  39.23 
 
 		 203 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  34.52 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  44.5 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  39.9 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  40.28 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  39.23 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  39.23 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0525  hypothetical protein  42.78 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  35.29 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  41.05 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  35.44 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  34.54 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  39.7 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  36.17 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  36.17 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  39.01 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  36.13 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  36.17 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  38.83 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  36.02 
 
 		 303 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>