More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2180 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  42.23 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  38.1 
 
 		 203 aa  141  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  34.88 
 
 		 213 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  37.62 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  38.79 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  32.85 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  36.57 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  36.57 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  37.04 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  37.04 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  37.04 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  37.04 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  37.04 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.23 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  35.19 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.84 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  37.14 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  32.04 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  34.58 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  36.11 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  35.71 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  33.8 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  36.84 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  35.35 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  34.58 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  34.47 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  34.58 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  34.43 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.18 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  33.64 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  35.1 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  34.11 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  33.8 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  33.81 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  32.55 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  33.81 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  37.2 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  34.76 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  35.38 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  36.95 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  36.95 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  35.96 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  32.24 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  35.96 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  36.45 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  36.45 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  36.45 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  36.45 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  36.45 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  37.02 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  36.45 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  36.45 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  36.46 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  33.18 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  37.09 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  34.88 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  38.28 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3937  hypothetical protein  36.95 
 
 		 210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000127693  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  38.37 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  32.86 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  37.5 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  33.18 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  31.92 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  35.29 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  35.35 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  36.23 
 
 		 199 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  36.78 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0587  yadS protein  35.65 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  35.75 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  37.72 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  36.78 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  36.78 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  33.49 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  30.99 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  30.99 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  33.64 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  37.14 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  31.6 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  32.39 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  36.78 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  33.65 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  35.78 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  34.93 
 
 		 202 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  34.78 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  35.63 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  31.1 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  35.27 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  29.91 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  29.63 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  30.33 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  28.7 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  29.17 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  29.17 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  29.33 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  31.78 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>