More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2822 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
218 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  76.96 
 
 
223 aa  289  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  49.02 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  44.85 
 
 
203 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20420  predicted membrane protein  49.02 
 
 
330 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  41.29 
 
 
230 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  43.65 
 
 
211 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  41.09 
 
 
218 aa  144  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  40.19 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  40.29 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  36.32 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  37.88 
 
 
211 aa  125  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  40.8 
 
 
217 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  39.39 
 
 
209 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  37.5 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  42.27 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  39.38 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  39.38 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  39.38 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.94 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  35.6 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  36.13 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  36.42 
 
 
263 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  39.69 
 
 
208 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  39.59 
 
 
206 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  36.08 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  34.34 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  35.89 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  34.36 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  39.59 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  38.02 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  35.5 
 
 
209 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  35.2 
 
 
218 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  33.82 
 
 
204 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  33.68 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  34.47 
 
 
211 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  39.73 
 
 
216 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  34.47 
 
 
211 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  36.89 
 
 
251 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  35.44 
 
 
207 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  40.79 
 
 
204 aa  105  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  39.59 
 
 
222 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  42.86 
 
 
207 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  31.77 
 
 
211 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  30.05 
 
 
317 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  35.32 
 
 
206 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15050  predicted membrane protein  35.27 
 
 
292 aa  101  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0337653  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  35.57 
 
 
209 aa  101  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  37.31 
 
 
212 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  34.36 
 
 
217 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  35.75 
 
 
211 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  34.9 
 
 
220 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.55 
 
 
213 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  32.04 
 
 
203 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  39.3 
 
 
209 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.55 
 
 
213 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.55 
 
 
213 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.55 
 
 
213 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  38.01 
 
 
218 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  38.01 
 
 
218 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  37.11 
 
 
222 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  40.38 
 
 
207 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  34.67 
 
 
217 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  40.72 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  27.32 
 
 
203 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  39.1 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  37.95 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  36.11 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  37.37 
 
 
207 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  36.41 
 
 
211 aa  99  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  35.41 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.51 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33.84 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  34.02 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  28.86 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  32.49 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  32.84 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  36.13 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  38.61 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  39.24 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  35 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.51 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.51 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  35.6 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  35.83 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  33.51 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  39.74 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  36.7 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  33.85 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2740  protein of unknown function UPF0126  33.49 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  34.38 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  34.38 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  37.31 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  39.13 
 
 
207 aa  95.1  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  39.51 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  39.7 
 
 
209 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>