More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0857 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  480  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  56.17 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  36.2 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  39.25 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  38.79 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  35.98 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  32.72 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  36.11 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  34.87 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  36.18 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  34.42 
 
 		 203 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.09 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  34.9 
 
 		 208 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  34.16 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.37 
 
 		 205 aa  95.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  37.25 
 
 		 212 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  37.25 
 
 		 212 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  32.04 
 
 		 206 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  37.8 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  37.25 
 
 		 212 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  35.86 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  35.86 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  31.03 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  35.19 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  35.82 
 
 		 217 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  36.23 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  38.78 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1387  protein of unknown function UPF0126  35.9 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  31.68 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  33.82 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  31.51 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  36.36 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  37.84 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  32.18 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  37.2 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  32.61 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  33.77 
 
 		 207 aa  85.1  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  34.62 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  30.39 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  28.64 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  32.54 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  33.14 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  33.14 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  32.72 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  30.65 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  33.82 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  37.5 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  32.02 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  35.82 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  34.22 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  36.62 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  34.93 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  35.24 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  34.53 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  35.14 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  35.82 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  35.82 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  33.6 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  36.3 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.07 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  28.57 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  36.09 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  34.76 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.36 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  35.04 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  34.38 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  30.7 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  30.99 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  30.99 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  30.58 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  31.85 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  31.85 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  31.07 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  31.85 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.31 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.31 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  32.03 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  32.51 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  28.08 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  28.08 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  28.36 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  32.05 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  32.05 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  33.58 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  33.58 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  33.58 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  33.58 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  33.58 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  38.06 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.5 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>