More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0584 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  526  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  58.99 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  38.1 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  36.65 
 
 
230 aa  148  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  42.94 
 
 
209 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  39.49 
 
 
211 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  38.61 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  34.74 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  36.42 
 
 
218 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  34.78 
 
 
221 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  33.98 
 
 
208 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  41.03 
 
 
212 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  41.03 
 
 
212 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  41.03 
 
 
212 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.5 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  34.65 
 
 
213 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  35.53 
 
 
201 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  33.18 
 
 
209 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  34.78 
 
 
222 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  31.43 
 
 
215 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  39.22 
 
 
212 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  37.43 
 
 
223 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  31.55 
 
 
209 aa  105  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  35.37 
 
 
217 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  36.05 
 
 
216 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  32.3 
 
 
205 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  32.63 
 
 
209 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  32.63 
 
 
209 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  34.47 
 
 
207 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  33.51 
 
 
219 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  32.55 
 
 
217 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  32.3 
 
 
205 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  35.23 
 
 
208 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  37.42 
 
 
211 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  36.6 
 
 
211 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  33.98 
 
 
207 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  34.31 
 
 
215 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  33.33 
 
 
206 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  34.09 
 
 
222 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  32.37 
 
 
207 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  32.65 
 
 
213 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  32.65 
 
 
213 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  32.65 
 
 
213 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  35.33 
 
 
205 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  32.65 
 
 
213 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  31.47 
 
 
231 aa  99  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  36.07 
 
 
206 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.41 
 
 
211 aa  99  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33.16 
 
 
213 aa  99  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  33.16 
 
 
213 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  36.08 
 
 
208 aa  99  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  32.18 
 
 
203 aa  98.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.44 
 
 
206 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  30.05 
 
 
205 aa  98.2  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  41.22 
 
 
208 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  41.22 
 
 
208 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  28.5 
 
 
203 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  32.98 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  32.65 
 
 
213 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  32.65 
 
 
213 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  34.78 
 
 
207 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  36.94 
 
 
203 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.38 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  40.82 
 
 
206 aa  96.3  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  33.52 
 
 
212 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  35.57 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  32.84 
 
 
207 aa  96.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  40.54 
 
 
208 aa  96.3  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  36.84 
 
 
204 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  39.86 
 
 
208 aa  95.9  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  36.2 
 
 
206 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1387  protein of unknown function UPF0126  32.85 
 
 
205 aa  95.5  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  39.07 
 
 
206 aa  95.5  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  40.54 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  30.92 
 
 
207 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  40.54 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  40.54 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  40.54 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  33.93 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  32.02 
 
 
207 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  31.68 
 
 
202 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  32.67 
 
 
207 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  31.19 
 
 
207 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  31.19 
 
 
207 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  35.85 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  31.53 
 
 
207 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  32.56 
 
 
220 aa  92.8  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  26.79 
 
 
303 aa  92.4  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  36.91 
 
 
203 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  36.91 
 
 
203 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  38.93 
 
 
206 aa  92  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  30.26 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  33.53 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  31.73 
 
 
206 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  31.74 
 
 
208 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  34.23 
 
 
207 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  30.05 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>