More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3969 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  62.67 
 
 		 231 aa  237  8e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  61.95 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  64.25 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  60.29 
 
 		 217 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  43.2 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  47 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  53.09 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  46.27 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  51.23 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  51.23 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  47.47 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  51.23 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  50.74 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  44.16 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  43.93 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  47.76 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1034  hypothetical protein  48.02 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.859571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  40.19 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  42.25 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  42.78 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  37.98 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  38.24 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.39 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  42.13 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  44.04 
 
 		 208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  41.67 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  41.67 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  43.35 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  41.67 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  46.11 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  43.07 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  38.31 
 
 		 203 aa  128  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.13 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  35.05 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  39.17 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  43.98 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  38.89 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  40.59 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  38.34 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  38.78 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  45.96 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  34.9 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  34.36 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  37.81 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  37.43 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  38.69 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  38.1 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  40.91 
 
 		 207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  38.73 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  35.38 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  35.38 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  32.99 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  39.5 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  32.08 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  37.93 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  37.93 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  37.93 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  32.39 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  32.39 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  37.93 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  38.5 
 
 		 206 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  37.44 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.16 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  37.44 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  34.13 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  36 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  31.6 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  36.54 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  39.58 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  34.8 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  37.63 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  36.76 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4542  hypothetical protein  42.93 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0210008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  33.5 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  36.1 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  39.8 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  35.71 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  39.69 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  31.1 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  31.1 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  31.1 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  31.1 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  35.92 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  35.35 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37.24 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  37.24 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  41.67 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  36.76 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  40.61 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>