More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2988 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  91.89 
 
 
222 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  91.44 
 
 
222 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  62.96 
 
 
217 aa  247  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  51.69 
 
 
217 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2740  protein of unknown function UPF0126  45.85 
 
 
225 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  45.18 
 
 
245 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  35.71 
 
 
209 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  35.71 
 
 
209 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  40.61 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.34 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.15 
 
 
209 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  37.76 
 
 
208 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  37.5 
 
 
211 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  39.22 
 
 
212 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  34.95 
 
 
205 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  31.31 
 
 
200 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.75 
 
 
205 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  37.8 
 
 
218 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  32.18 
 
 
317 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  31.63 
 
 
222 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.75 
 
 
205 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  31.5 
 
 
209 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  37.36 
 
 
219 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  37.84 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  35.86 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  35.57 
 
 
218 aa  99  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  41.06 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  36.04 
 
 
210 aa  98.2  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  38.69 
 
 
205 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  36.76 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  36.76 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  35.96 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  37.21 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  36.92 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  32.99 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  39.38 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  34.03 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  36.65 
 
 
207 aa  96.3  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  34.03 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1950  protein of unknown function UPF0126  46.76 
 
 
224 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.791374  hitchhiker  0.00643781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  34.57 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  34.88 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  34.88 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18070  predicted membrane protein  29.56 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  34.39 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04050  predicted membrane protein  30.1 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.818037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  30.85 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  33.68 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  32.43 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  31.38 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  36.67 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  34.9 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  36.87 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  35.75 
 
 
222 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  34.39 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  35.64 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  30.85 
 
 
203 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  30.85 
 
 
203 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  33.01 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  35.27 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  31.41 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  35.08 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  32.98 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  38.74 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  37.69 
 
 
203 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  33.68 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  35.6 
 
 
208 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  37.43 
 
 
223 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  35 
 
 
211 aa  92  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  30.35 
 
 
203 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  33.51 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  35.08 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  36.67 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  33.51 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  34.04 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  30.88 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  31.38 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  39.26 
 
 
246 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  37.24 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  37.11 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  37.11 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.06 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  37.11 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.86 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0302  protein of unknown function UPF0126  39.58 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  38.46 
 
 
208 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  30.35 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  33.75 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  37.44 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  29.08 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  35.24 
 
 
303 aa  87.8  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  35.86 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  36.27 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  40.37 
 
 
207 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>