More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0302 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0302  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 239 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  37 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  39.52 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  37.26 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  34.27 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  36.49 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  31.56 
 
 		 264 aa  101  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  38.38 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  40.1 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  36.02 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04050  predicted membrane protein  30.8 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.818037 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  32.65 
 
 		 317 aa  99.8  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  39.63 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  32.23 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  36.63 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  36.06 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  38.27 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  38.81 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2740  protein of unknown function UPF0126  33.82 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  35.71 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  37.81 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  41.88 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  35.27 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.79 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  36 
 
 		 217 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  31.22 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  31.22 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  40.39 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  35.41 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  38.34 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  37.74 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  33.51 
 
 		 209 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  39.75 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  36.95 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  39.75 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  34.2 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  39.75 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  35.44 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  31.37 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.64 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0017  protein of unknown function UPF0126  30.6 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000429816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  28.5 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  37.34 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  32.99 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  34.39 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3937  hypothetical protein  34.33 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000127693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.51 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  36.11 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  32.5 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  32.82 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1950  protein of unknown function UPF0126  40.99 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.791374  hitchhiker  0.00643781 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  30.35 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  43.2 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  31.53 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  39.24 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  29.84 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  31.76 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  31.47 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  30.85 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  35 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  32.84 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  32.84 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  36.3 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  35.96 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  30.05 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  32.34 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  29.53 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  33.68 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.48 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  37.43 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  34.21 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  31.5 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.16 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  33.51 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  33.51 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  32.12 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  29.13 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  32.12 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  34.43 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  32.12 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  32.12 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  38.67 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  38.67 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  40.59 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>